Biologia molekularna - Problemy z transkrypcją.

Interesuje mnie problem inicjacji transkrypcji u E.coli. Chodzi mi o wyjasnienie kwestii podstawowej-w którym miejscu rozpocząć ma RNAP transkrypcję,czyli co determinuje ten proces?Promotor kanoniczny dla sigma 70 jest znany(tylko analiza tych genów mnie na razie interesuje,i to konstytutywnych np.rybosomalnych,cykl Krebsa,replikacja,translacja..),choć są różnice w zalezności od jego siły,a na to ma wpływ jego sekwencja.Swkwencje UP mają często wpływ na jego ekspresje(wydajność),ale są one zróżnicowane,a mimo to RNAP potrafi jakoś w tym heterogenicznym pejzażu molekularnym odnależć elementy wspólne.Pytanie -czym sie ona kieruje?Bez wątpienia czynniki transkrypcyjne TF pełnia tu rolę kluczową,ale faktem jest:
-wiekszość promotorów sigma 70 nie wymaga (in vivo) TF dla jego aktywacji-patrz baza RegulonDb
-te ,które wymagają posiadają miejsca wiązania dla wielu TF,a nie tylko tych potwierdzonych in vivo.Ciekawe,czym sie kieruje komórka wybierając te,a nie inne TF-sama sekencja nie może byc tu jedynym kryterium,tym bardziej ,że niektóre wiążą sie niespecyficznie bądż mało specyficznie np.HNS.To jest o tyle zagadkowe ,że u drozdzy niemal wszystkie geny mają TF,a u E.coli tylko część,mimo,że teoretycznie (symulacje komputerowe),jak i eksperymenty in vitro ,potwierdzają podobną sytuację.Jakiś czynnik o nieznanej naturze nie dopuszcza jednak do ich wiązania.
Powtarzam-interesuje mnie tylko ten genom,ale nie w w kazdej mozliwej sytuacji np.stres ,ale w typowej,stąd wybór genów niezbędnych dla zycia.

LOL chyba nie to forum..

może w bibliotece PANu cos mają na ten temat?

Jeśli chcesz, aby ktoś pomógł Ci w pisaniu pracy magisterskiej / doktorskiej, zaproponuj mu coś konkretnego w zamian, a nie próbuj pod przykrywką "swobodnej" dyskusji na naukowe tematy żerować na przypadkowej "współpracy" innych. Widziałem prawdopodobnie Twoje posty na różnych forach biotechnologicznych (wnioskuję to z ich treści) i z tego, co zauważyłem nie mają one cech luźnej wymiany poglądów, a raczej starasz się wymusić na ludziach, z którymi prowadzisz dialog rozwiązanie Twojego konkretnego problemu. Poza tym nie za bardzo podoba mi się Twój protekcjonalny ton wobec innych w ww. dyskusjach ([link widoczny dla zalogowanych], [link widoczny dla zalogowanych]).

Jednak w odpowiedzi na Twoją prośbę mogę polecić przeszukanie medycznych baz danych, takich jak [link widoczny dla zalogowanych] albo [link widoczny dla zalogowanych]. Poza tym znalazłem coś [link widoczny dla zalogowanych]. Być może tam znajdziesz odpowiedzi na swoje pytania.